【文件属性】：
文件名称：seqtk:用于处理FASTAQ格式的序列的工具包
文件大小：25KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-04 01:42:48
bioinformatics sequence-analysis C
介绍
Seqtk是一种快速轻巧的工具，用于处理FASTA或FASTQ格式的序列。 它可以无缝解析FASTA和FASTQ文件，也可以选择使用gzip对其进行压缩。 要安装seqtk ，
git clone https://github.com/lh3/seqtk.git ;
cd seqtk ; make
唯一的库依赖项是zlib。
Seqtk示例
将FASTQ转换为FASTA：
seqtk seq -a in.fq.gz > out.fa
将ILLUMINA 1.3+ FASTQ转换为FASTA并将质量低于20的碱基蒙版转换为小写字母（第一个命令行）或N （第二个）：
seqtk seq -aQ64 -q20 in.fq > out.fa
seqtk seq -aQ64 -q20 -n N in.fq > out.fa
折叠长的FASTA / Q线并删除FASTA / Q注
【文件预览】：
seqtk-master
----khash.h(18KB)
----kseq.h(8KB)
----LICENSE(1KB)
----seqtk.c(59KB)
----.gitignore(22B)
----Makefile(272B)
----README.md(2KB)