pySeqkit:用于处理FASTAQ格式的序列的工具包

【文件属性】：
文件名称：pySeqkit:用于处理FASTAQ格式的序列的工具包
文件大小：11KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-13 22:29:59
sequence-analysis Python pySeqkit 用于处理FASTA / Q格式的序列的工具包 1.简介 pySeqkit是用于处理FASTA或FASTQ格式的序列的工具包，它以python编写并且仍在开发中。 要安装它，您可以 git clone https://github.com/FlyPythons/pySeqkit.git 该工具包已经在python2.7中进行了测试 2.例子 pySeqkit现在有两个子命令（stat，split）。 序列文件的统计信息（fastA / Q） 对于FASTA / Q文件，可以一起统计不同格式的文件 python pySeqkit.py stat 1.fq *.fa > in.stat 使用'-c'加快处理过程 python pySeqkit.py stat -c 10 1.fq *.fa > in.stat 一个文件包含FASTA / Q文件路径 pytho

【文件预览】：
pySeqkit-master
----.gitignore(1KB)
----pySeqkit.py(1KB)
----LICENSE(1KB)
----seqkit()
--------__init__.py(83B)
--------FastqReader.py(3KB)
--------stat.py(6KB)
--------split.py(5KB)
--------FastaReader.py(3KB)
--------common.py(2KB)
----README.md(1KB)