seqkit:跨平台,超快速的工具包,用于在Golang中操纵FASTAQ文件

时间:2021-03-07 12:42:41
【文件属性】:
文件名称:seqkit:跨平台,超快速的工具包,用于在Golang中操纵FASTAQ文件
文件大小:28.73MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-07 12:42:41
golang bioinformatics cross-platform tool toolkit SeqKit-用于FASTA / Q文件操作的跨平台超快速工具包 文档: : (,,和) 源代码: : 最新版本: : 介绍 FASTA和FASTQ是用于存储核苷酸和蛋白质序列的基本且普遍存在的格式。 FASTA / Q文件的常见操作包括转换,搜索,过滤,重复数据删除,拆分,混排和采样。 现有工具仅实现了其中一些操作,而没有特别有效地实现,而某些工具仅可用于某些操作系统。 此外,所需软件包和运行环境的复杂安装过程会使这些程序的用户友好性降低。 该项目描述了用于FASTA / Q处理的跨平台超快速综合工具包。 SeqKit为所有主要操作系统(包括Windows,Linux和Mac OS X)提供可执行二进制文件,并且可以直接使用而无需任何依赖项或预先配置。 与类似工具相比,SeqKit展示了在执行时间和内存使用方面的竞争性能。 SeqKit的效率和可用性使研究人员能够快速完成常见的

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