文件名称：epicPCR:用于解析来自乳液、配对分离和串联 PCR 的序列数据的脚本
文件大小：9KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-30 17:20:53
Python
史诗PCR 从epicPCR 库解析序列数据的脚本。 10/29/2014 Sarah J. Spencer，麻省理工学院 Alm 实验室 本文件的内容 介绍 要求 安装 命令行参数 维护者 参考 介绍 从双端数据的原始 fastq 文件开始，运行以下命令列表以生成 16S 读取的精选 fasta 文件以及epicPCR 库中的操作分类单元。 脚本可以是包含在QIIME包或者是自定义可以在脚本 。 如果您使用新的引物组和目标基因准备了一个 epicPCR React，您应该修改自定义脚本 filterBar.py 或 filterDSRb.py 以识别您定制的融合结构。 要求 Perl 版本 5.10.1 Python 版本 2.7.6 QIIME 1.8.0 版 安装 Perl 可从下载 Python 可从下载 QIIME 可从下载 此目录中的自定义 python 和 perl
【文件预览】：
epicPCR-master
----fastq2Qiime_barcode.pl(662B)
----filterDSRb.py(3KB)
----LICENSE(1KB)
----compressBar.py(3KB)
----filterLength.py(1KB)
----filterBar.py(2KB)
----README.md(5KB)
----discardChimeras.py(2KB)