文件名称：nmf的matlab代码-CaImAn:卡门
文件大小：95.22MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 10:49:23
系统开源
nmf的matlab代码卡门 一种计算工具箱用于大规模的Ca lcium林老化数据的alysis和行为分析。 钙成像采集技术的最新进展正在创建大约TB /周的数据集。 需要使用内存和计算效率高的算法来分析合理数量的时间TB的数据。 该项目实施了钙成像电影分析流程中所需的一组基本方法。 实现了快速且可扩展的算法，用于运动校正，电影处理以及源和峰值提取。 CaImAn还包含一些用于分析摄像机行为的例程。 总而言之，CaImAn提供了处理大型电影的通用工具，并具有针对两光子和单光子钙成像和行为数据集的特殊强调工具。 特征 处理非常大的数据集 内存映射 补丁中的并行处理 逐帧在线处理 基于OpenCV高效电影播放和调整大小 运动校正 快速并行化基于OpenCV和FFT的大型电影的运动校正 也可以在线模式运行（即一次一帧） 纠正由于光栅扫描或大脑运动不均匀而导致的非刚性伪影 源提取 基于约束非负矩阵分解（CNMF）分离不同的源 处理严重重叠且被Neuroopil污染的电影 适用于2光子和1光子钙成像数据 使用预训练卷积神经网络分类器选择推断源 可在线处理 去噪，去卷积和尖峰提取 从荧光痕迹推断神