文件名称：nmf的matlab代码-Caiman_edit:凯门鳄
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文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-15 10:48:35
系统开源
nmf的matlab代码卡门 一种计算工具箱用于大规模的Ca lcium林老化数据的alysis和行为分析。 钙成像采集技术的最新进展正在创建大约TB /周的数据集。 需要使用内存和计算效率高的算法来分析合理数量的时间TB的数据。 该项目实施了钙成像电影分析流程中所需的一组基本方法。 实现了快速且可扩展的算法，用于运动校正，电影处理以及源和峰值提取。 CaImAn还包含一些用于分析摄像机行为的例程。 总而言之，CaImAn提供了处理大型电影的通用工具，特别着重于两光子和单光子钙成像和行为数据集的工具。 伴侣纸 可以在此找到解释大多数实施细节和基准测试的论文 特征 处理非常大的数据集 内存映射 补丁中的并行处理 逐帧在线处理 基于OpenCV高效电影播放和调整大小 运动校正 快速并行化基于OpenCV和FFT的大型电影的运动校正 也可以在线模式运行（即一次一帧） 纠正由于光栅扫描或大脑运动不均匀而导致的非刚性伪影 可以在GPU上计算FFT（实验性）。 需要安装pycuda和skcuda。 源提取 基于约束非负矩阵分解（CNMF）分离不同的源 处理严重重叠且被Neuropil污染的电影 适