文件名称：psf的matlab代码-eFOV_microendoscopes_sim:Antonini等人的仿真代码
文件大小：5.94MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 23:55:23
系统开源
psf的matlab代码eFOV_microendoscopes_sim Antonini et al，2020，bioRxiv的仿真代码 此代码从合成数据生成人工时间序列。 它随机地将给体放置在一定体积中，并模拟它们的尖峰活动。 然后，使用两种不同类型的内窥镜模拟人造体积的成像，一种不对像差进行校正，而另一种对像差进行校正。 随附的论文为： 扩展视野超薄型微型内窥镜，用于在清醒的小鼠中以最小的侵入力进行高分辨率的双光子成像 安德里亚·安东尼（Andrea Antonini），安德里亚·萨丁（Andrea Sattin），莫妮卡·莫罗尼（Monica Moroni），塞雷娜·博韦蒂（Serena Bovetti），克劳迪奥·莫雷蒂（Claudio Moretti），弗朗西斯卡·舒克尔，安吉洛·福利（Angelo Forli），达尼亚·维奇亚（Vaniachiakumar P. 2020年，生物多样性，doi： 在运行模拟代码之前，必须从DOI下载一些辅助文件：10.17632 / wm6c5wzs4c.1（dataset_3，文件夹Imaging_ellipsoids，intensit
【文件预览】：
eFOV_microendoscopes_sim-main
----simulated_TS()
--------20201005_sim_TS001()
----LICENSE(34KB)
----.DS_Store(6KB)
----main_simulate_TSeries_only.m~(9KB)
----main_estimate_rois_size_and_density.m(3KB)
----pixel_size.mat(128B)
----README.md(1KB)
----utilities()
--------PSF_distribution()
--------neural_activity_simulation()
--------segmentation()
--------signal_analyses()
--------sample_generation()
--------TimeSeries_generation()
----count_ROIs_SNR.m(2KB)
----pixels_noise.mat(129B)
----main_estimate_rois_size_and_density_RULER.m(6KB)
----main_simulate_TSeries_only.m(7KB)
----main_estimate_px_noise.m(8KB)
----ROI_size.mat(129B)
----.gitattributes(1B)
----deconvolve_activity.m(320B)