psf的matlab代码-Bfactors:因素

时间:2024-06-12 23:53:44
【文件属性】:

文件名称:psf的matlab代码-Bfactors:因素

文件大小:117.86MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-12 23:53:44

系统开源

psf的matlab代码list984.txt:sbNMA计算中使用的984个高分辨率蛋白质结构的PDB-id列表。 该列表按结构的大小(残基数)排序。 pdbsAndpsfs:此文件夹包含7个zip文件。 这7个zip文件包含list984.txt中所有结构的autopsf生成的pdb和psf文件。 这些pdb和psf文件用于sbNMA计算。 sbNMAmagnitudesOfVibrations.zip:此zip文件包含根据list984.txt中所有结构的sbNMA(在100 K下)计算出的热振动幅度。 对于list984.txt中的每个PDB-id,都有一个(PDB-id).sbNMA文件,其中包含单个原子的热振动幅度,其列出的顺序与原子在相应的autopsf生成的pdb文件中列出的顺序相同。 .sbNMA文件存储在sbNMAmagnitudesOfVibrations.zip中。 完整的sbNMA代码可在以下位置获得:


【文件预览】:
Bfactors-master
----list984.txt(12KB)
----README.md(914B)
----sbNMAmagnitudesOfVibrations.zip(8.77MB)
----pdbsAndpsfs()
--------pdbsAndpsfs-7.zip(2.55MB)
--------pdbsAndpsfs-3.zip(20.47MB)
--------pdbsAndpsfs-2.zip(15.83MB)
--------pdbsAndpsfs-4.zip(21.99MB)
--------pdbsAndpsfs-5.zip(22.1MB)
--------pdbsAndpsfs-1.zip(17.06MB)
--------pdbsAndpsfs-6.zip(20.57MB)

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