pyFastq:简单的python 2.7库解析fastq文件和处理illumina 1.8+ fastq序列

时间:2021-06-04 17:29:59
【文件属性】:
文件名称:pyFastq:简单的python 2.7库解析fastq文件和处理illumina 1.8+ fastq序列
文件大小:5KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-04 17:29:59
Python pyfastq 0.1 解析fastq文件和处理illumina 1.8+ fastq序列的简单python 2.7库 创作时间:2015/04/02 最后更新 : 2015/04/02 快速阅读器 读取 fastq 文件并生成 FastqSeq 对象的迭代器的解析函数。 当文件为空时,生成器会引发一个 StopIteration 异常,指示解析的有效序列的数量。 如果 fastq 序列无效,则跳过此序列。 空格后面的序列名称的任何部分都将被删除 FastqSeq :表示 Fastq 序列的简单对象 FastqSeq 是一个简单的 Python 对象类,生成表示 Fastq 序列的对象。 对象初始化为: 不带@ 的序列名称 作为字符串的 DNA 序列 质量分数,如在PHRED 33在Illumina 1.8+编码质量字符串,整数的在PHRED 33一个numpy.ndarray或整数
【文件预览】:
pyFastq-master
----.gitignore(702B)
----FastqSeq.py(3KB)
----__init__.py(685B)
----FastqReader.py(2KB)
----README.md(2KB)

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