bam2fastq:从bam到FASTQ的简单转换器

时间:2024-06-13 11:46:35
【文件属性】:

文件名称:bam2fastq:从bam到FASTQ的简单转换器

文件大小:10KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-13 11:46:35

C++

bam2fastq bam2fastq是一个从BAM文件中提取序列和质量的程序。 原始版本可以在找到。 随后对其进行了修改,以处理具有成对和不成对读和写到stdout混合的BAM文件。 安装 需要make,gcc和zlib压缩库-所有这些都应该存在于大多数类Unix系统(包括Mac)上。 首先从github克隆存储库,包括其依赖项: git clone --recursive https://github.com/jts/bam2fastq 然后转到目录并运行make: cd bam2fastq make 作者 该程序最初由Phillip Dexheimer在HudsonAlpha开发。 它打包在github上,并由Jared Simpson稍加修改。


【文件预览】:
bam2fastq-master
----.gitmodules(86B)
----LICENSE(9KB)
----HISTORY.txt(147B)
----samtools()
----Makefile(865B)
----README.md(842B)
----bam2fastq.cpp(14KB)

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