dna:用于Ruby的生物序列文件(fasta,fastq,qseq)解析器

时间:2024-05-19 03:36:40
【文件属性】:

文件名称:dna:用于Ruby的生物序列文件(fasta,fastq,qseq)解析器

文件大小:13KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-19 03:36:40

ruby parser bioinformatics dna Ruby

脱氧核糖核酸 Ruby的生物序列文件解析器 奥斯汀·戴维斯·理查森(Austin G.Davis-Richardson) 特征 支持的格式() 自动格式检测 延迟迭代 安装 在Ruby 1.9.3和2.0.0上测试 $ (sudo) gem install dna 用法 require 'dna' # Automatic Format Detection File . open ( 'sequences.fasta' ) do | handle | records = Dna . new handle records . each do | record | puts record . length end end File . open ( 'sequences.fastq' ) do | handle | records = Dna . new handl


【文件预览】:
dna-master
----.travis.yml(66B)
----bin()
--------dna(339B)
----dna.gemspec(2KB)
----readme.md(2KB)
----Rakefile(1KB)
----.rvmrc(27B)
----Gemfile(166B)
----.rspec(13B)
----spec()
--------data()
--------dna_spec.rb(2KB)
--------record_spec.rb(2KB)
--------phred_spec.rb(2KB)
--------spec_helper.rb(644B)
----.gitignore(24B)
----lib()
--------dna()
--------dna.rb(153B)

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