文件名称：fastq-pair:快速高效地匹配配对的末端fastq文件
文件大小：321KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-04 11:31:08
C
快速配对 重写配对的末端fastq文件，以确保所有读取都具有配对并分离出单例。 这段代码做一件事：它需要两个fastq文件，并生成四个fastq文件。 是的，免费提供，使您拥有的fastq文件数量增加了一倍！！ 通常，当您获得配对的末尾读取文件时，您将拥有两个文件，一个文件中的/ 1序列，另一个文件中的/ 2序列（或/ f和/ r或仅两个具有相同ID的读取）。 但是，通常在处理来自第三方来源（例如 ）的文件时，每个文件中的读取次数会有所不同（因为某些读取无法通过质量检查）。 黑桃，bowtie2和其他工具损坏，因为它们要求配对的最终文件具有相同的读取次数。 该程序解决了该问题。 它按顺序重写这些文件，并在命令行上提供两个文件的匹配文件，然后将任何不匹配的单次读取放置在两个单独的文件中，每个原始文件一个。 此代码旨在快速且高效地存储内存，并且可与大型fastq文件一起使用。 它不会
【文件预览】：
fastq-pair-master
----.travis.yml(99B)
----INSTALLATION.md(1KB)
----CITATION.md(2KB)
----main.c(3KB)
----fastq_pair.h(1KB)
----test()
--------left.fastq(252KB)
--------right.fastq(78KB)
--------right.fastq.gz(24KB)
--------right_R2.fastq(79KB)
--------left_R1.fastq(255KB)
--------left.fastq.gz(77KB)
----fastq_pair.c(9KB)
----LICENSE(1KB)
----CHANGES.md(192B)
----VERSION(4B)
----.gitignore(483B)
----is_gzipped.h(194B)
----CMakeLists.txt(244B)
----is_gzipped.c(459B)
----robstr.c(1KB)
----README.md(6KB)
----test_gzip.c(549B)
----robstr.h(640B)