文件名称：fq_delta:高效存储fastq文件的处理版本
文件大小：35KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-24 03:51:50
Python
Fq_delta - fastq 文件处理版本的有效存储。 Fq_delta 是一个 python 模块和 shell 脚本，可以存储由 DNA 和 RNA 测序技术生成的 fastq 文件的处理版本。 通过使用允许对两个字符串进行逐字符比较的 Myer diff 算法，我们从原始和编辑过的 fastq 文件生成增量文件。 虽然 fq_delta 生成的 delta 文件可用于完全重建原始文件，但它们只是原始大小的一小部分 (0.1 – 2%)。 根据处理步骤的数量，该模块的实施将导致处理序列数据所需的存储量显着减少。 有关 fq_delta 的技术说明已在发布。 安装 首先克隆git存储库， git clone git://github.com/averaart/fq_delta.git 进入 fq_delta 仓库目录 cd fq_delta 使用 python setup.
【文件预览】：
fq_delta-master
----COPYING.txt(2KB)
----scripts()
--------delta(3KB)
--------test_fq_delta(8KB)
--------rebuild(3KB)
----fq_delta()
--------fq_delta.py(10KB)
--------__init__.py(22B)
----setup.py(625B)
----README.md(2KB)
----diff_match_patch()
--------diff_match_patch_test.py(41KB)
--------__init__.py(59B)
--------diff_match_patch.py(66KB)