文件名称：PERJ:配对末端读加入
文件大小：1.44MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-14 05:46:07
Perl
PERJ 配对末端读段连接（PERJ），用于将配对末端读段连接到一个片段中 工具功能：从两个文件中加入两个照明配对端读数，具有5个末端修整选项，以fasta（1）或fastq（2）输出，在左右读数之间填充Ns，修整低质量的读数 #input数据是两个fastq文件和选项的名称 如何使用这个工具 PERJ可以在命令行或图形界面中运行。 都在工作。 命令终端的用法： perl PERJ.pl [选项] 选项：-l文件：向左读取fastq格式的文件 -r文件：右以fastq格式读取文件 -format整数：1用于fasta中的输出序列或2用于fastq中的输出序列 -trimleft整数：清除左读取的核苷酸的多少bp，默认值：0 -trimright整数：清除要正确读取的核苷酸的多少bp，默认值：0 -n整数：在左右读取之间的间隔中插入多少个核苷酸的核苷酸，默认值：0，对于标准Illum
【文件预览】：
PERJ-main
----testOUT_format2.txt(5KB)
----testOUT_format1.txt(3KB)
----LICENSE(34KB)
----PERJ_graphic.png(47KB)
----TTGGATGG_2_48.fq(3KB)
----TTGGATGG_1_48.fq(3KB)
----README.md(2KB)
----PERJ.jar(26KB)
----PERJ_manual_en_V11.pdf(1.53MB)
----PERJ.pl(7KB)