文件名称:Intro-to-rnaseq-hpc-salmon-flipped:批量RNA序列介绍
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更新时间:2024-04-04 20:29:07
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使用高性能计算(HPC)的RNA-seq简介 观众 所需的计算能力 期间 生物学家 没有 3节在线研讨会(约7.5个小时,由讲师指导) 描述 该资料库提供了为期2天的RNA测序数据分析研讨会的教学材料。 该研讨会的重点是教授基本的计算技能,以有效利用高性能计算环境来实现RNA-seq数据分析工作流程。 它包括对shell(bash)和shell脚本的介绍。 除了运行来自FASTQ文件的RNA-seq工作流程以使用Salmon进行数据计数外,研讨会还涵盖了RNA-seq实验设计和数据组织/管理的最佳实践准则。 培训师注意事项:请注意,以下链接的时间表假定学习者将花费3-4个小时在阅读和完成各节课之间所选课程的练习上。 讲习班的在线部分着重于更多练习和讨论/问答。 这些材料是为培训师主导的讲习班开发的,但也适合进行自学学习。 学习目标 了解用于分析高通量测序数据的命令行界面(bash)和H