rail:可扩展的RNA序列分析

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文件名称：rail:可扩展的RNA序列分析
文件大小：113.4MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-28 19:37:12
emr ipython alignments mapreduce rna-seq-analysis 是用于RNA序列分析的软件。 它用于生成项目的输出，自2021年1月起不推荐使用。请改用生成可与的后继）进行比较的RNA-seq输出。 网站。 最新的稳定版本。 阅读 ， 特别是 。 在仓库中询问问题 。 产生兴趣 Rail-RNA的显着特征是 可扩展性。 该软件基于MapReduce构建，可扩展以同时分析数百个RNA-seq样品。 减少冗余。 该软件可以识别并消除多余的比对工作，从而随着样本数量的增加，减少了固定计算机集群大小下每个样本的端到端分析时间。 综合分析。 该软件利用重复样本的优势来实现更准确的剪接连接检测，尤其是在覆盖率较低的基因组区域中。 模式不可知论。 该软件集成了自己的并行抽象层，使其可以在各种分布式计算环境中运行，包括Amazon Web Services（AWS）弹性MapReduce（EMR）服务或IPython支持的任何分布式环境，包括使用批处理调度