文件名称：bcbio-nextgen：经过验证的，可扩展的，社区开发的变异调用，RNA-seq和小RNA分析
文件大小：16.97MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-09 05:39:58
Python
经过验证的，可扩展的，社区开发的变异调用，RNA序列和小RNA分析。 您编写一个高级配置文件，指定您的输入和分析参数。 此输入驱动并行运行，以处理分布式执行，幂等处理重新启动和安全的事务处理步骤。 bcbio提供了一个共享的社区资源，用于处理测序分析的数据处理部分，从而为研究人员提供了更多时间专注于下游生物学。 特征 社区发展：我们欢迎贡献者的目标是克服生物学，算法和计算方面的挑战，这些挑战是在快速变化的研究领域中从事复杂管道开发的个体开发人员所面临的挑战。 有关bcbio-nextgen部署的示例，请参见我们的；有关贡献的技巧，请参见 。 安装： 准备所有第三方软件，数据库和系统配置文件。 ：将变量调用与常见参考材料或特定SNP阵列样品进行比较，以确保调用正确性。 结合多种用于比对，准备和变异调用的方法，可以实现算法的无偏比较。 分布式：专注于以处理大量人群研究和整个基因组分析。