文件名称：Pfeature:肽和蛋白质特征的计算
文件大小：3.1MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-30 09:38:06
Python
特征：肽和蛋白质特征的计算 介绍 Pfeature是一款全面的软件，可以计算过去几十年来发现的各种蛋白质/肽特征。 它基于以下五个主要模块来计算蛋白质特征： i）组成； ii）二进制配置文件； iii）进化信息； iv）结构和v）模式。 基于组成的模块允许用户进行计算； i）简单的成分，如氨基酸，二肽，三肽； ii）基于理化性质的组合物； iii）氨基酸的重复和分布； iv）香农熵来测量低复杂度区域； iv）杂类成分，如假氨基酸，自相关，三联体，准序列顺序。 氨基酸序列的二进制图谱提供了完整的信息，包括残基的顺序或残基的类型，而这是基于组合物的特征所无法实现的。 因此，二进制图谱可用于在残基水平上注释蛋白质。 在文献中已经很好地确立了，基于进化信息的序列图谱提供了比序列本身更多的信息。 我们已经开发了许多Pfeature的异构体，包括：i）通过通过Web界面使用Pfeature功能的We
【文件预览】：
Pfeature-master
----LICENSE(130B)
----PyLib()
--------Pfeature.zip(499KB)
--------README.md(1KB)
--------Functions_Tables.pdf(84KB)
----Descriptor_headers.pdf(219KB)
----Standalone()
--------envfile(251B)
--------pfeature_standalone.zip(328KB)
--------pfeature_comp.py(141KB)
--------protein.fa(368B)
--------Requirement.txt(461B)
--------LICENSE(34KB)
--------protein.seq(347B)
--------README.md(4KB)
--------Data()
--------README.txt(14KB)
--------pfeature_bin.py(88KB)
--------Screenshot.png(127KB)
--------pfeature_pssm.py(9KB)
--------Pfeature_Descriptors.pdf(219KB)
----scripts()
--------readme(65B)
--------Pfeature_scripts.zip(624KB)
----README.md(4KB)
----Feature_Description.pdf(161KB)
----Pfeature_Manual.pdf(1.17MB)