文件名称:lightdock:基于GSO算法的蛋白质-蛋白质,蛋白质-肽和蛋白质-DNA对接框架
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更新时间:2024-05-28 22:31:02
bioinformatics chemistry structural-biology molecular-structures protein-structure
1.概要 LightDock是基于(GSO)算法的蛋白质,蛋白质,肽和蛋白质-DNA对接框架。 LightDock框架具有高度的通用性,有许多选项可以由用户进一步开发和优化:它可以接受任何用户定义的评分功能,可以使用局部无梯度最小化,可以从一开始就限制仿真用户指定的相互作用区域,它支持受体和配体伙伴中的残基限制。 2.参考 LightDock协议和利用残留限制的更新已在杂志上发表。 如果您在研究中使用LightDock,请引用以下参考: LightDock:一种新的多尺度蛋白质对蛋白质对接方法BrianJiménez ,Jorge Roel-Touris,Miguel Romero-Durana,Miquel Vidal,DanielJiménez-González和JuanFernández-Recio 生物信息学,第34卷,第1期,2018年1月1日,第49-55页, //do