文件名称：MICA-aligner:基于英特尔:registered:MIC的下一代测序短读比对仪-开源
文件大小：2.15MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-20 11:16:30
开源软件
GitHub上的最新代码：https://github.com/aquaskyline/MICA-aligner为了更好地利用支持MIC的计算机进行NGS数据分析，我们开发了一种新的短读对准器MICA，针对MIC的局限性和其他优点对其进行了优化。每个MIC内核内部的并行性。 对齐150bp配对末端读段的实验表明，使用一块MIC板的MICA比基于CPU（多核）的BWA-MEM快约4.85倍，并且速度与基于GPU的SOAP3-dp差不多。 此外，当一个节点中使用多个MIC板时，MICA的简单性可以实现非常有效的放大（3张卡的速度是6核BWA-MEM的14倍）。