文件名称：NNmapper:执行短读映射-开源
文件大小：298.1MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-18 12:47:32
开源软件
NNmapper构造参考读取库，并计算库读取和查询读取之间的欧几里得距离。 NNmapper可以将查询读取映射为（1）到给出最小距离（最相似）的库读取，（2）到给出最小距离而距离小于阈值的库读取，或者（3）所有库读取的距离小于阈值。 NNmapper具有很高的容错能力，适用于任何读取长度。 NN报告所有映射位置以进行多次读取。 需要安装MATLAB。 需要Mac或Linux系统。
【文件预览】：
NNmapper
----NNmapper User Manual.docx(36KB)
----NNMapping_TwoFiles.m(58KB)
----Example()
--------ShortReads()
--------LibrarySeq()
----NNMapping_SingleFile.m(62KB)
----DataBase()
--------PreSetRange()
--------ConfLevel()
--------TStoMAQ()
----ReferenceIndexing.m(9KB)
----TSpreset_TSThreshold.m(18KB)
----MatlabResultToSAM.m(36KB)
----ConfLevel_MAQ_Calculator.m(13KB)