文件名称:SOAPdenovo2:下一代测序从头读
文件大小:1.57MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-03 13:32:05
bioinformatics genome assembly computational-biology soapdenovo
SOAPdenovo2的手册 关于MEGAHIT MEGAHIT可处理单细胞测序数据和超基因组数据。 与SOAPdenovo相比,它生成更长的重叠群,并消耗更少的内存。 要搭建由MEGAHIT生成的重叠群,请使用SOAPdenovo-fusion。 它是一个准备模块,它将重叠群作为输入并生成可被SOAPdenovo的map and scaff模块连续使用的文件。 参考: MEGAHIT:通过简洁的Bruijn图,用于大型和复杂宏基因组学组装的超快速单节点解决方案 对于MAC用户 请使用来SOAPdenovo。 SOAPdenovo在Homebrew-science中的软件包由Shaun Jackman管理。 介绍 SOAPdenovo是一种新颖的短读组装方法,可以为人类大小的基因组构建从头开始的草图组装。 该程序是专门为汇编Illumina GA短读而设计的。 它为建立参考序列和以