文件名称:颅骨分割matlab代码-Automated-Lesion-Detection-Public:自动检测公共检测
文件大小:185.67MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-16 16:41:51
系统开源
颅骨分割matlab代码自动检测 关于 该管道旨在仅使用T1加权MRI自动检测中风患者的脑部病变。 管道结合了无监督和有监督的方法来检测脑部病变。 首先,无监督方法执行从原始空间到标准空间的统一分割归一化图像,并生成不同组织类型(灰质,白质和液体)的概率图。 这使我们可以通过将标准化MRI与健康对照对象进行比较来构建初始病变概率图(LPM)。 然后,我们执行基于非刚性和可逆图集的配准,以细化灰质,白质,CSF和病变的概率图。 这些概率图与归一化MRI结合以构建三种类型的特征,我们使用监督方法来训练三个支持向量机(SVM)分类器以用于组合分类器。 最后,组合分类器用于完成病变检测。 版本 2015年4月15日 用法 安装 该管道要求您已安装Matlab和SPM8。 将“ AutomatedLesionDetection”文件夹及其所有内容放在SPM的工具箱文件夹中。 病变分割示例(使用预先生成的图像) 启动Matlab并启动SPM8(通过在Matlab命令行中输入“ spm fmri”)。 在SPM主窗口中按“批处理”按钮以显示“批处理编辑器”窗口 在“批处理”窗口中,选择“ SPM /
【文件预览】:
Automated-Lesion-Detection-Public-master
----TestT1andGroundTruthLesion.zip(9.76MB)
----ALD_GenerateAverageMRI.m(155B)
----README.md(3KB)
----SVM_Mac()
--------svm_classify(30KB)
--------svm_learn(113KB)
----InitialLesionEstimation.m(3KB)
----SVM_Linux()
--------svm_classify(28KB)
--------svm_learn(115KB)
----Inverse_Normalize.m(1KB)
----massCenter.m(4KB)
----Templates()
--------rTemplate_whole_SoftTissue.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_SoftTissue.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_WM.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_NonBrain.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_CSF.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_CSF.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_SoftTissue.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_GM.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_Air.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_GM.nii(8.1MB)
--------BrainMask_02.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_WM.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_NonBrain.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_WM.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_Air.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_CSF_NoVentricle.nii(8.1MB)
--------BrainMask.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_CSF_NoVentricle.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_Ventricle.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_Ventricle.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_CSF_NoVentricle.nii(8.1MB)
--------LeftHemiMask.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_NonBrain.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_CSF.nii(8.1MB)
--------rTemplate_rh_Bone.nii(8.1MB)
--------rTemplate_lh_Bone.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_Air.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_Bone.nii(8.1MB)
--------RightHemiMask.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_Ventricle.nii(8.1MB)
--------rTemplate_whole_GM.nii(8.1MB)
--------Average_T1.nii(8.1MB)
----ALD_ModelTraining.m(2KB)
----tbx_cfg_AutoLesionDetectioin_Tool.m(7KB)
----EnantiomorphicNormalization.m(9KB)
----SVM_Runner.m(1KB)
----SVM_Windows()
--------svm_learn.exe(424KB)
--------svm_classify.exe(316KB)
----GenerateHealtyAverageMRI.m(6KB)
----ALD_ModelTesting.m(2KB)
----SVM_Train.m(1KB)
----Final_CleanUp.m(4KB)
----Generate_MRI.m(4KB)
----get_Feature3D_filter_window.m(11KB)
----TestDat_SVM_Feature_SVM.m(21KB)
----Modified_NewSegment.m(11KB)