文件名称：颅骨分割matlab代码-SLS:SLS
文件大小：4.65MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-16 16:42:31
系统开源
颅骨分割matlab代码SLS（Salem病变分割） 关于： SLS工具箱的实现最初是用C ++开发到Matlab中的。 性能测试： 我们已经针对原始C ++代码评估了Matlab实现的性能。 比较测试是使用Vall d'Hebron医院中心提供的70幅图像（3T）进行的。 之前，所有图像都经过了颅骨剥离，强度校正和去噪处理。 Matlab和C ++ SLS实现中都使用相同的图像蒙版。 首先，我们评估了通过两种SLS实现获得的最终病变蒙版之间的Dice系数（DSC）。 在所有图像中，实现之间的DSC值均高于0.83。 观察到的差异是由于sigma估计值的微小变化（ <0.01 ）。 但是，与提供的真实注释相比，遮罩之间的差异在每种实现方式的准确性方面均无关紧要。 我们将每个SLS实现的DSC系数与手动注释的掩码（GT）进行了比较。 两种SLS实施的性能实际上是相同的。 用法： 查找附带的test_SLS.m脚本来测试工具箱，其中包含一个示例图像，其中包含MS患者图像以及必要的FLAIR和T1 3级组织分割。 clear all; image_folder = 'test_data';
【文件预览】：
SLS-master
----test_SLS.m(2KB)
----DSC_between_masks.png(26KB)
----lesionSegmentationTool.m(4KB)
----DSC_between_gt.png(9KB)
----save_compressed_nii.m(918B)
----README.md(3KB)
----compute_fwhm.m(2KB)
----test_data()
--------GT.nii.gz(24KB)
--------T1segmentation.nii.gz(223KB)
--------SLS_mask.nii.gz(32KB)
--------FLAIR.nii.gz(4.42MB)
----compute_neighborhoods.m(3KB)
----load_compressed_nii.m(937B)