颅骨分割matlab代码-SLSToolBox:自动化的白质病变分割

时间:2021-05-27 22:54:22
【文件属性】:
文件名称:颅骨分割matlab代码-SLSToolBox:自动化的白质病变分割
文件大小:196KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-27 22:54:22
系统开源 颅骨分割matlab代码SLS(SALEM病变分割) SALEM-LS(SLS)是一种新算法,旨在对MRI FLAIR图像上的WM病变进行分割。 此工具需要原始的T1加权图像或其组织分割。 如果找到T1加权图像作为输入,我们首先将T1w图像共同注册到FLAIR图像。 从此以后,所有分析都在这个空间中进行。 我们在T1w图像上分割组织,并对FLAIR图像进行预处理(降噪,强度校正和归一化)。 之后,将WM病变分割为GM分布的异常值。 最终,所检测到的异常值是潜在的候选病变,将通过病变大小和上下文信息(组织类型和邻域组织类型)进行过滤。 可以施加另一限制,包括避免附接到心室的细长区域。 离群值检测分两个步骤进行,首先,我们获得较大的病灶,从而允许使用更宽松的过滤器。 在第二步中,我们在寻找小病变时会更加保守地应用这些过滤器。 尽管给出了一组默认值,但所有这些参数都可以进行调整以获得更好的精度。 SLS当前既可以作为现成的Matlab功能下载,也可以作为SPM12库下载。 有用的资源部分包含所有可用的软件源代码(以zip文件形式)。 在安装前,请检查“需求”选项卡。 请浏览SALEM网页以获
【文件预览】:
SLSToolBox-master
----intCorrect.m(2KB)
----SLS.man(2KB)
----license.txt(31KB)
----lesionSegmentationTool.m(6KB)
----spm_SLS.m(1KB)
----deformBack.m(2KB)
----coreg.m(2KB)
----structures()
--------.DS_Store(6KB)
--------ventricles.nii(8.1MB)
----image_enhancement()
--------iic-1.0.3()
--------anisodiff3D.m(11KB)
--------.DS_Store(6KB)
----README.md(3KB)
----compute_fwhm.m(2KB)
----lesionSeg_run.m(5KB)
----tissueSegment.m(5KB)
----compute_neighborhoods.m(3KB)
----niftiTools()
--------rri_zoom_menu.m(770B)
--------save_nii.m(8KB)
--------make_nii.m(7KB)
--------save_nii_hdr.m(9KB)
--------rri_xhair.m(2KB)
--------unxform_nii.m(1KB)
--------license.txt(1KB)
--------examples.txt(4KB)
--------mat_into_hdr.m(3KB)
--------bipolar.m(2KB)
--------rri_select_file.m(17KB)
--------bresenham_line3d.m(5KB)
--------load_untouch0_nii_hdr.m(8KB)
--------load_nii_ext.m(4KB)
--------rri_orient_ui.m(6KB)
--------save_untouch_nii_hdr.m(9KB)
--------save_nii_ext.m(1015B)
--------save_untouch_nii.m(6KB)
--------flip_lr.m(3KB)
--------load_untouch_nii_hdr.m(9KB)
--------xform_nii.m(18KB)
--------make_ana.m(6KB)
--------save_untouch0_nii_hdr.m(9KB)
--------load_nii_hdr.m(10KB)
--------collapse_nii_scan.m(6KB)
--------load_untouch_nii_img.m(15KB)
--------view_nii.m(143KB)
--------load_nii.m(5KB)
--------save_untouch_slice.m(13KB)
--------reslice_nii.m(8KB)
--------rri_file_menu.m(4KB)
--------get_nii_frame.m(3KB)
--------verify_nii_ext.m(2KB)
--------view_nii_menu.m(14KB)
--------rri_orient.m(2KB)
--------load_untouch_header_only.m(5KB)
--------load_nii_img.m(12KB)
--------extra_nii_hdr.m(8KB)
--------load_untouch_nii.m(4KB)
--------expand_nii_scan.m(700B)
--------affine.m(16KB)
----tbx_cfg_SLS.m(13KB)

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