
算法原理
map阶段
在map阶段,需要做的是进行数据准备。把来自矩阵A的元素aij,标识成p条<key, value>的形式,key="i,k",(其中k=1,2,...,p),value="a:j,aij";把来自矩阵B的元素bij,标识成m条<key, value>形式,key="k,j"(其中k=1,2,...,m),value="b:i,bij"。
经过处理,用于计算cij需要的a、b就转变为有相同key("i,j")的数据对,通过value中"a:"、"b:"能区分元素是来自矩阵A还是矩阵B,以及具体的位置(在矩阵A的第几列,在矩阵B的第几行)。
shuffle阶段
这个阶段是Hadoop自动完成的阶段,具有相同key的value被分到同一个Iterable中,形成<key,Iterable(value)>对,再传递给reduce。
reduce阶段
通过map数据预处理和shuffle数据分组两个阶段,reduce阶段只需要知道两件事就行:
<key,Iterable(value)>对经过计算得到的是矩阵C的哪个元素?因为map阶段对数据的处理,key(i,j)中的数据对,就是其在矩阵C中的位置,第i行j列。
Iterable中的每个value来自于矩阵A和矩阵B的哪个位置?这个也在map阶段进行了标记,对于value(x:y,z),只需要找到y相同的来自不同矩阵(即x分别为a和b)的两个元素,取z相乘,然后加和即可。
过程如下图所示:
算法实现
mapper.py
#!/usr/bin/env python3
import sys flag = 0 # 0表示输入A、B矩阵信息,1表示处理A矩阵,2表示处理B矩阵
row_a, col_a, row_b, col_b = 0, 0, 0, 0 # A、B矩阵shape
current_row = 1 # 记录现在处理矩阵的第几行 def read_input():
for lines in sys.stdin:
yield lines if __name__ == '__main__':
for line in read_input():
if line.count('\n') == len(line): # 去空行
pass
data = line.strip().split('\t') if flag == 0:
flag = 1
row_a = int(data[0])
col_a = int(data[1])
row_b = int(data[2])
col_b = int(data[3])
if row_a == 0 or row_b == 0 or col_a == 0 or col_b ==0 or col_a != row_b:
print("矩阵输入错误!")
break elif flag == 1:
for i in range(col_b):
for j in range(col_a):
print("%s,%s\tA:%s,%s" % (current_row, i+1, j+1, data[j]))
current_row += 1
if current_row > row_a:
flag = 2
current_row = 1 elif flag == 2:
for i in range(row_a):
for j in range(col_b):
print("%s,%s\tB:%s,%s" % (i+1, j+1, current_row, data[j]))
current_row += 1
reducer.py
这是我一开始所写的版本。
#!/usr/bin/env python3
import sys last, now = None, None
s = 0.0
count = 0
matrix_a, matrix_b = {}, {} def read_input():
for lines in sys.stdin:
yield lines if __name__ == '__main__':
for line in read_input():
if line.count('\n') == len(line): # 去空行
pass
data = line.strip().split('\t')
now = data[0]
if last is None:
last = now
count = 0
elif last != now:
for key in matrix_a:
s += float(matrix_a[key])*float(matrix_b[key])
print("%s\t%s" % (last, s))
s = 0.0
count = 0
last = now value1 = data[1][0]
value2 = data[1].split(':')[1].split(',')[0]
value3 = data[1].split(',')[1]
if value1 == 'A':
count += 1
matrix_a[value2] = value3
else:
matrix_b[value2] = value3 for key in matrix_a:
s += float(matrix_a[key])*float(matrix_b[key])
print("%s\t%s" % (last, s))
后来借鉴参考了别人的代码后,学习了groupby,下面的代码就简洁多了。
#!/usr/bin/env python3
import sys
from itertools import groupby
from operator import itemgetter def read_input(splitstr):
for line in sys.stdin:
line = line.strip()
if len(line) == 0:
continue
yield line.split(splitstr) if __name__ == '__main__':
data = read_input('\t')
lstg = (groupby(data, itemgetter(0)))
try:
for flag, group in lstg:
matrix_a, matrix_b = {}, {}
total = 0.0
for element, g in group:
matrix = g.split(':')[0]
pos = g.split(':')[1].split(',')[0]
value = g.split(',')[1]
if matrix == 'A':
matrix_a[pos] = value
else:
matrix_b[pos] = value
for key in matrix_a:
total += float(matrix_a[key]) * float(matrix_b[key])
print("%s\t%s" % (flag, total))
except Exception:
pass
算法运行
执行结果为:
参考:
[1] 用MapReduce实现矩阵乘法
[3] MapReduce实现矩阵乘法