文件名称：buRden:用于执行“负担”测试的 Rcpp 函数
文件大小：423KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-24 15:19:39
C++
#Association 测试软件来自 Thornton 实验室 ##获取源码 git clone https://github.com/molpopgen/buRden ##依赖 v3.1.0 或更高版本 v0.11.1 或更高版本 C++ 库 该软件包已在 OS X Mavericks 上使用各种版本的 （所有版本 4.6.4 或更高版本）和 （版本 clang-503.0.38）进行了测试。 ＃＃安装 最直接的方法是通过 R 的包： library(devtools) install_github("molpopgen/buRden") 该软件包也可以“传统”方式安装： R CMD INSTALL buRden 要安装到自定义位置： R_LIBS=/path/to/special/place R CMD INSTALL buRden 或者，使用 devtools
【文件预览】：
buRden-master
----NAMESPACE(200B)
----DESCRIPTION(344B)
----src()
--------chisq.cc(942B)
--------stat_calculator.cc(623B)
--------randWrapper.cc(131B)
--------chisq_per_marker.hpp(219B)
--------allstats.cc(6KB)
--------MBstat.cc(4KB)
--------stat_MadsenBrowning.hpp(604B)
--------stat_allstats.hpp(697B)
--------esm_chisq.cc(3KB)
--------stat_cAlpha.hpp(537B)
--------stat_cAlpha.cc(2KB)
--------stat_LiLeal.cc(5KB)
--------stat_calculator.hpp(242B)
--------filter_sites.cc(3KB)
--------stat_allstats.cc(2KB)
--------ProductMoment.cc(2KB)
--------stat_base.hpp(848B)
--------chisq.hpp(198B)
--------randWrapper.hpp(97B)
--------RcppExports.cpp(12KB)
--------MBstat.hpp(170B)
--------ProductMoment.hpp(271B)
--------chisq_per_marker.cc(1KB)
--------cAlpha.cc(4KB)
--------esm.cc(5KB)
--------filter_sites.hpp(289B)
--------stat_MadsenBrowning.cc(4KB)
--------stat_LiLeal.hpp(696B)
--------stat_chisq.hpp(370B)
--------stat_chisq.cc(1KB)
--------Makevars.in(38B)
--------esm.hpp(138B)
----R()
--------perms.R(9KB)
--------logitTests.R(4KB)
--------ccpcgc.R(3KB)
--------RcppExports.R(21KB)
--------buRden-package.r(3KB)
----configure(137KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(2KB)
----configure.ac(744B)
----data()
--------rec.esizes.RData(9KB)
--------rec.ccdata.RData(318KB)
----man()
--------cAlpha_perm.Rd(2KB)
--------calpha.p.perm.Rd(2KB)
--------filter_sites.Rd(1KB)
--------allBurdenStatsPerm.Rd(2KB)
--------rec.ccdata.Rd(1KB)
--------ccpvals.Rd(1KB)
--------rec.esizes.Rd(790B)
--------allBurdenStats.Rd(2KB)
--------MB.p.perm.Rd(1KB)
--------esm.Rd(1KB)
--------esm_chisq.Rd(1KB)
--------esm_perm_binary.Rd(1KB)
--------buRden.Rd(1KB)
--------chisq_per_marker.Rd(1KB)
--------allBurdenStats.p.perm.Rd(3KB)
--------logit.recessive.Rd(664B)
--------MB_perm.Rd(1KB)
--------calc.Gij.Rd(688B)
--------logit.additive.Rd(555B)
--------MBstat.Rd(1KB)
--------logit.dominant.Rd(658B)
--------chisq.Rd(576B)
--------norm.genos.Rd(495B)
--------esmw.Rd(1KB)
--------LLcollapse.Rd(1KB)
--------MBweights.Rd(849B)
--------esm.p.perm.Rd(1KB)
--------cAlpha.Rd(2KB)
--------cc2pcgc.Rd(1KB)
--------LLcollapse_perm.Rd(1KB)
--------ProductMoment.Rd(741B)
----redoc.sh(96B)
----.gitignore(177B)