connexplore:交互式皮层连接浏览器

时间:2024-07-16 05:24:39
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文件名称:connexplore:交互式皮层连接浏览器

文件大小:760KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-07-16 05:24:39

Python

连接浏览器 扩展,用于交互式探索 Freesurfer 皮层模型上的连接数据。 该工具旨在与描述 Freesurfer 表面上定义的区域节点之间的边权重的数据集一起使用。 它最适合功能连接分析,但它是普遍实现的,任何可以用这种方式描述的数据都可以使用。 要使用它,您需要输入两个数据结构: matrix :一个正方形对称矩阵,其中每个单元格是行节点和列节点之间连接的权重。 这应该是一个以区域名称作为索引和列的 Pandas DataFrame 对象。 区域名称的唯一限制是它们必须以"lh"或"rh"开头以标识它们所在的半球。 names:一个 Pandas DataFrame,其区域名称对应于左右半球网格中的每个顶点。 每个顶点都必须有一个名称,但名称可以是matrix索引和列名称的超集(即,您的数据集可能缺少某些区域的数据)。 有关如何构建输入数据的想法,请参阅示例数据。 用法


【文件预览】:
connexplore-master
----data()
--------yeo17_nodes.csv(2.5MB)
--------resting_matrix.csv(76KB)
----LICENSE.md(1KB)
----README.md(4KB)
----screenshot.png(672KB)
----connexplore.py(5KB)

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