文件名称:metabolicmodeling:来自Chandrasekaran实验室的基于约束的代谢建模软件
文件大小:265KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-14 00:43:18
python matlab constraint-based-modeling omics-data-integration fluxomics
Chandrasekaran实验室的基于约束的优化算法 该存储库包含可用于集成多个组学数据并分析基于约束的代谢重建的代码。 依存关系 此存储库中的许多功能都需要或库来执行特定的建模任务。 此外,对于优化问题,还需要。 贡献 欢迎捐款! 请阅读贡献指南以开始使用。 也可以随时提交错误,功能请求和请求请求。
【文件预览】:
metabolicmodeling-master
----Python()
--------.ipynb_checkpoints()
--------QP_example.ipynb(9KB)
--------QP_example.html(353KB)
--------CFR.py(2KB)
--------knockOut.py(2KB)
--------reconstruction.py(1KB)
--------Untitled.ipynb(72B)
--------.Rhistory(0B)
--------CFR.ipynb(2KB)
--------metabolicModeling.py(26KB)
--------gpr.csv(33KB)
--------CFR_tests.ipynb(2KB)
----.idea()
--------misc.xml(174B)
--------workspace.xml(137B)
--------metabolicmodeling.iml(284B)
--------inspectionProfiles()
--------modules.xml(286B)
--------rSettings.xml(174B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(693B)
----MATLAB()
--------Tests()
--------Constrainers()
--------PRIME()
--------ReactionActivity()
--------Reconstruction()
--------misc()
----_config.yml(26B)
----.whitesource(138B)