文件名称:CBMPy:基于PySCeS约束的建模-开源
文件大小:573KB
文件格式:WHL
更新时间:2024-05-18 11:04:19
开源软件
PySCeS CBMPy是用于基于约束的建模和分析的新平台。 它是根据PySCeS仿真软件项目中开发的原则进行设计的:可用性,灵活性和可访问性。 CBMPy支持最新的编码标准,用于编码CBM模型编码,SBML L3 FBC,COBRA以及符合MIRIAM的RDF和自定义注释。 使用生物学家直观的数据结构,同时透明地将其转换为基础的数学结构,其体系结构既可扩展,又具有灵活性。 。 CBMPy执行流行的分析,例如FBA,FVA,元素/电荷平衡,网络分析和模型编辑,以及为生态系统建模开发的高级方法。 CBMPy通过以下方式支持用户交互:-交互式控制台或作为高级使用的库-GUI,模型的可视表示,分析方法-基于SOAP的webAPI通过Web服务公开了高级功能