文件名称：期权matlab代码-cobrapy:COBRApy是用于基于约束的代谢网络建模的软件包
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更新时间：2024-06-15 10:55:01
系统开源
预算matlab代码COBRApy-Python中基于约束的重构和分析 什么是COBRApy？ COBRA方法已广泛用于原核生物和真核生物中代谢网络的基因组规模建模。 COBRApy是基于约束的建模软件包，旨在适应下一代COBRA模型的生物学复杂性，并提供对常用COBRA方法的访问，例如通量平衡分析，通量变异性分析和基因缺失分析。 我们与COBRApy的目标是为以下方面提供有用，高效的基础架构： 创建和管理代谢模型 访问流行的求解器 使用FVA，FBA，pFBA，MOMA等方法分析模型 检查模型并得出关于基因重要性的结论，测试敲除的结果等。 我们使用COBRApy的目标是使其自身有用，并使其成为希望构建新的COBRA相关python软件包（例如可视化，应变设计和数据驱动分析）的开发人员的基础结构的自然选择。 通过重复使用相同的类和设计原则，我们可以使新方法更易于实现和使用，从而将COBRA的功能带给更多的研究人员。 该文档可在上在线浏览，也可以在上。 请向寻求帮助。 通过编写一个精心设计的问题，并提供足够详细的信息，您很有可能会很快得到一个很好的答案！ 请参考这些有关如何提问的知识。