Rascaf:具有RNA-seq读取比对的支架

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文件名称：Rascaf:具有RNA-seq读取比对的支架
文件大小：996KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-02 11:18:35
C 腊卡夫 描述于： Song，L.，Shankar，D.和Florea，L.“ Rascaf：使用RNA-seq数据改善基因组装配”，植物基因组，2016年。doi：10.3835 / plantgenome2016.03.0027。 Liliana Florea的Li Song版权所有（C）2015-2016和GNU GPL Rascaf包含以下源代码： SAMtools-恒立基因研究有限公司（C）2008-2009版权所有 什么是腊肠？ Rascaf（RnA-seq SCAFfolder）使用来自配对末端RNA-seq读数的连续性和顺序信息来改善草图装配，尤其是在基因区域。 它以装配体和与基因组对齐的一个或几个RNA-seq数据集为输入，并在装配体中募集额外的重叠群，可能会调节一些支架以更好地拟合数据并创建更长的基因模型。 Rascaf的工作分为三个阶段。 它首先从RNA序列数