【文件属性】：
文件名称：鲑鱼：使用选择性比对，可从RNA-seq读取物中进行高精度且快速的转录本水平定量
文件大小：7.22MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-03-03 15:42:53
c-plus-plus bioinformatics rna-seq gene-expression rnaseq
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预先计算的诱饵转录组
tl; dr：快速是好的，但是快速和准确的更好！ 尽管预先计算的诱饵（<= v.14.2）仍与最新的主要发行版（v1.0.0）兼容。 我们建议您使用完整的基因组更新索引，因为它可以提供更高的准确性。 有关更多信息，请在最新修订的预印本查看我们的广泛基准测试，以比较不同的比对方法及其在RNA-seq定量方面的性能。 请使用该的逐步指南，了解如何有效地索引参考转录组和基因组，以进行基于准确的双端核糖核酸的RNA序列定量。
具体来说，可以通过3种可能的方式创建鲑鱼指数：
仅限cDNA的索引：salmon_index- ://combine-lab.github.io/salmon/getting_started/。 此方法将产生最小的索引，并需要最少的资源来构