文件名称：spaghetti:序列重叠组装和支架的可视化比对
文件大小：19.97MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-23 21:13:30
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Spaghetti：可视化序列重叠组装和脚手架的对齐图 使用实时工具： : Spaghetti 是一种基于 Web 的可视化工具，用于可视化测序读取组装和重叠群支架。 您可以查看段之间的边缘重叠并调整对齐阈值以帮助解决相邻片段的（希望是线性的）结构。 Spaghetti 与几种常见的对齐格式兼容，包括： （由 LAST 和其他人输出） m4（blasr 输出） （由 Bowtie 和其他人输出） Spaghetti 使用力导向布局来迭代改进对齐图布局。 根据图形的大小，可视化在两种模式之间无缝转换。 对于大型图形（> 1000 条边），会显示一个非交互式但可导航的图形，用户可以放大和缩小，并四处拖动视口以检查图形。 对于较小的图形，视口是固定的，但可能会显示节点（读取/重叠）标签，并且可能会拖动单个节点。 此外，如果您单击一个节点，所有相邻的节点（根据边缘过滤标准）都会突
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