文件名称：Sequence Assembly App：根据参考组装重叠序列-matlab开发
文件大小：31KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-19 04:00:22
matlab
组装重叠序列，尤其是批量样本，是一项艰巨的任务。 此应用程序旨在帮助用户按样本将多组序列导入 MATLAB，将它们剪辑到公共参考序列（通过 Smith-Waterman 局部比对），确定它们的重叠（也是 Smith-Waterman），并将它们组装成单个全序列构建体。 可以使用预先格式化的 FASTA 或通过顺序复制到剪贴板来导入序列。 处理后，可以选择具有可接受长度和参考局部比对分数的构造进行导出。 导出选项包括在多次全局比对后将剪切的序列、核苷酸组装和/或蛋白质翻译提供给 FASTA、序列查看器应用程序和/或序列比对应用程序。 如果您发现此应用程序有用或希望看到任何更改/添加，请提供反馈。
【文件预览】：
Sequence%20Assembly.zip