vcflib:用于解析和处理VCF文件的C ++库和cmdline工具

时间:2024-05-30 06:09:12
【文件属性】:

文件名称:vcflib:用于解析和处理VCF文件的C ++库和cmdline工具

文件大小:18.53MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-30 06:09:12

genomics variant-calling genotyping haplotypecaller vcf-manipulation

vcflib 一个用于解析和处理VCF文件的C ++库。 概述 是平面文件,制表符分隔的文本格式,用于描述个人之间引用索引的变体。 VCF提供了一种通用的交换格式来描述个体和样本群体中的变异,并已成为各种基因组变异检测器的事实上的标准报告格式。 vcflib提供了操作和解释VCF描述的序列变异的方法。 两者都是: 用于解析和操作基因组变异记录的API,可以用VCF格式描述 命令行实用程序的集合,用于对VCF文件执行复杂的操作 vclib既是一个库(带有API)又是有用工具的集合。 该API提供了一种快速且极其宽松的方法来读取和写入VCF文件。 随附的实用程序(* .cpp)中提供的库的扩展和应用程序构成了库实用程序的绝大部分。 短指数: 筛选 指标 表型 基因型 转型 统计数据 剧本 链接库 从源代码构建 发展 执照 安装 Bioconda Conda无需用户权限即可安装在用户


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