文件名称：Bio.VCF:VCF文件的CSharp解析器
文件大小：4.23MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-30 03:07:48
C#
生物VCF VCF文件的CSharp解析器。 可以遍历VCF文件，并提供对所有相关信息的类型化访问以及数据验证。 简单用法示例： string fname = @"MyFile.vcf"; VCFParser vcp = new VCFParser(fname); var myData=vcp.Where(x=>x.NoCallCount <20 && x.Biallelic).ToList();
【文件预览】：
Bio.VCF-master
----Bio.VCF.sln(2KB)
----GlobalSuppressions.cs(1KB)
----VCF()
--------VCFCompoundHeaderLine.cs(9KB)
--------VCFHeaderLineTranslator.cs(5KB)
--------IFeature.cs(2KB)
--------GenotypesContext.cs(21KB)
--------VCFHeaderLine.cs(3KB)
--------FastGenotype.cs(6KB)
--------VCFHeaderLineCount.cs(189B)
--------VCFInfoHeaderLine.cs(813B)
--------VCFHeader.cs(16KB)
--------VCFFormatHeaderLine.cs(1KB)
--------VCF3Codec.cs(2KB)
--------Allele.cs(18KB)
--------VCFSimpleHeaderLine.cs(3KB)
--------VCFHeaderVersion.cs(4KB)
--------VCFFilterHeaderLine.cs(1KB)
--------VCFCodec.cs(4KB)
--------VCFParser.cs(4KB)
--------VCFUtils.cs(529B)
--------VariantContext.cs(44KB)
--------AbstractVCFCodec.cs(32KB)
--------Genotype.cs(23KB)
--------VCFParsingError.cs(359B)
--------VariantContextUtils.cs(9KB)
--------VCFHeaderLineType.cs(1KB)
--------GenotypeType.cs(826B)
--------GenotypeLikelihoods.cs(15KB)
--------ParsingUtils.cs(5KB)
--------GeneralUtils.cs(6KB)
--------VCFStandardHeaderLines.cs(11KB)
--------NewCollections()
--------LazyGenotypesContext.cs(7KB)
--------VariantContextAccessMethods.cs(13KB)
--------VCFContigHeaderLine.cs(2KB)
--------writer()
--------VariantContextBuilder.cs(14KB)
--------FastStringUtils.cs(7KB)
--------VCFConstants.cs(5KB)
--------VCFIDHeaderLine.cs(1KB)
--------CommonInfo.cs(8KB)
--------GenotypeBuilder.cs(11KB)
--------VariantContextStatics.cs(1KB)
----Bio.VCF.csproj(5KB)
----Writer()
--------Options.cs(166B)
--------IntGenotypeFieldAccessors.cs(2KB)
--------VCFWriter.cs(20KB)
----TestVCF()
--------Program.cs(722B)
--------VCFComparison.csproj(3KB)
--------testData()
--------App.config(182B)
--------Properties()
----.gitignore(92B)
----README.md(337B)
----.gitattributes(483B)
----Properties()
--------AssemblyInfo.cs(1KB)