文件名称：seqExtract:通过给出基因名称从参考基因组中提取序列
文件大小：714KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-30 09:33:57
Python
序列提取 通过给出基因名称从参考基因组中提取序列 rescue.py 和 seq_extract_rescue.py 一起从宇宙文件中拯救缺失的基因。 seq_extract.py 只需要文件名作为输入。 ##seq_extract_rescue.py ####先决条件文件： GTF文件（基因转换格式） 人类参考基因 宇宙基因列表或基因名称列表 ####先决条件系统： pybedtools 皮萨姆 Python 2.7 ＃＃＃＃用法： usage: seq_extract_rescue.py [-h] -g file -t gtf_file -r ref_genome [-o STR] [-p STR] [-b INT] [-f] [-c] Extract target genes and generate bloo
【文件预览】：
seqExtract-master
----hgnc_table.tsv(2.59MB)
----README.md(2KB)
----seq_extract_rescue.py(7KB)
----cancer_gene_census_1.txt(3KB)
----seq_extract.py(5KB)
----rescue.py(5KB)
----cancer_gene_census.csv(96KB)