文件名称：gramtools:从群体参考图推断基因组
文件大小：339KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-26 04:48:40
python c-plus-plus bioinformatics variant-calling genome-graph
语法工具 TL; DR基因组推论使用先验信息编码为参考图。 Gramtools从一组变体中构建种群参考基因组（PRG）。 给定来自个体的序列数据，该图将被覆盖并进行基因分型，从而产生图中所有变异的VCF和 。 还可以推断出样品的个性化参考基因组，并且可以发现针对它的新变异（请参阅）。 然后，您可以根据初始变体和新变体构建新的PRG，并对该增强的PRG进行基因分型。 内容 安装 容器 运行gramtools的最简单方法是通过容器（）。 要与Docker一起运行： tag= " latest " # or, a specific released version docker run " quay.io/iqballab/gramtools: ${tag} " 以奇点运行： tag= " latest " # or, a specific released version\nURI=