文件名称:NRSC:非参考序列分类工具,用于宏基因组样本中的DNA序列
文件大小:30KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-27 21:04:59
Shell
1.关于 2.参考数据库 通过NCBI建立参考数据库: cd References/NCBI-Virus/ wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/genbank/viral/assembly_summary.txt awk -F '\t' '{if($12=="Complete Genome") print $20}' assembly_summary.txt > ASCG.txt mkdir -p GB_DB_VIRAL mkdir -p GB_DB_VIRAL_CDS mkdir -p GB_DB_VIRAL_RNA cat ASCG.txt | xargs -I{} -n1 -P8 wget -P GB_DB_VIRAL {}/*_genomic.fna.gz mv GB_DB_
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NRSC-main
----Results()
--------.gitignore(72B)
----src()
--------SyntheticGenerator()
--------install.bash(0B)
----NRSC.sh(12KB)
----References()
--------NCBI-Virus()
----GeneratedFiles()
--------.gitignore(71B)
----Logo.png(9KB)
----LICENSE(34KB)
----Input_Data()
--------adapters.fa(140B)
--------.gitignore(85B)
----README.md(669B)
----.gitignore(211B)
----Data_Security()
--------Encrypted_Data()
--------Decrypted_Data()
--------Encrypt_Input()
----Outputs()
--------.gitignore(71B)