【文件属性】:
文件名称:javase项目源码-htsjdk:用于高通量测序数据(HTS)格式的JavaAPI
文件大小:48.46MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-04 12:53:59
系统开源
java
se项目源码
用于高通量测序数据
(HTS)
格式的
Java
API。
HTSJDK
是一个统一的
Java
库的实现,用于访问常见的文件格式,例如
和
,用于高通量测序数据。
还有许多有用的实用程序可用于操作
HTS
数据。
注意:
HTSJDK
仅部分支持最新的
Variant
Call
Format
Specification。
VCFv4.3可以读不能写,不支持BCFv2.2
文档和获取帮助
自1.128以来所有
HTSJDK
版本的
API
文档均可通过
.
如果您认为自己发现了错误或库有问题,请
a)
搜索打开和最近关闭的问题以确保尚未报告,然后
b)
记录问题。
如果您想与开发人员和参与该项目的其他人聊天,该项目有一个。
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组。
构建
HTSJDK
HTSJDK
现在使用
.
包含一个包装脚本
(
gradlew
),它将在第一次调用时下载适当版本的
gradle。
来自
htsjdk
根目录的示例
gradle
用法:
编译并构建一个
jar
./gradlew
或者
./gradlew
jar
jar