hts-specs:SAMBAM 规格及相关高通量测序文件格式

时间:2024-08-23 12:41:18
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文件名称:hts-specs:SAMBAM 规格及相关高通量测序文件格式

文件大小:7.44MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-08-23 12:41:18

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SAM/BAM 及相关规范 粗体链接指向此存储库的上的相应 PDF。 请使用此存储库请求改进或报告错误,但如果您需要直接联系,请参阅。 有关如何从源文本生成 PDF 文档的说明,请参阅。 比对数据文件 是 SAM(序列比对/映射)格式、BAM(其二进制等效项)和用于索引 BAM 文件的 BAI 格式的规范规范。 是一个配套规范,描述了 SAM、BAM 和 CRAM 文件中的预定义标准可选字段和标签。 这些格式在中讨论。 是 CRAM 格式的规范规范,而描述了其现已过时的前身。 更多详细信息可以在。 CRAM 讨论也可以在。 和快速参考总结了最近的索引格式:tabix 工具索引通用文本基因组位置排序文件,而 CSI 是的 BAI 索引格式的继承者。 未对齐的序列数据文件 我们不定义或认可任何专用的未对齐序列数据格式。 相反,我们建议以一种对齐格式(SAM、BAM 或 CRAM)使用未


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