文件名称：svdetect.sh-开源
文件大小：409KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-21 08:02:48
开源软件
svdetect.sh 是一个 shell 脚本，用于运行 SVDetect 以检测外显子组序列中的 SV 和 Shatterproof 以检测染色体碎裂。 ***更新*** SVDetect的输出文件可以用多线程的基因进行注释。
【文件预览】：
gene_loc
----gene_loc_chr1_gl000192_random(21B)
----gene_loc_chr14(28KB)
----gene_loc_chr11(48KB)
----gene_loc_chrUn_gl000224(27B)
----gene_loc_chr4_ctg9_hap1(151B)
----gene_loc_chr17(45KB)
----gene_loc_chr7_gl582971_fix(22B)
----gene_loc_chr5(41KB)
----gene_loc_chr17_gl000205_random(23B)
----gene_loc_chr22_gl383582_alt(19B)
----gene_loc_chrUn_gl000222(60B)
----gene_loc_chr6_dbb_hap3(6KB)
----gene_loc_chr8(32KB)
----gene_loc_chr2(57KB)
----gene_loc_chr9(34KB)
----gene_loc_chr12(42KB)
----gene_loc_chrUn_gl000228(36B)
----gene_loc_chr9_gl339450_fix(17B)
----gene_loc_chr17_gl383560_fix(22B)
----gene_loc_chr22(18KB)
----gene_loc_chr17_ctg5_hap1(808B)
----gene_loc_chr4_gl000194_random(38B)
----gene_loc_chr1(87KB)
----gene_loc_chr19_kb021647_fix(42B)
----gene_loc_chr6_mcf_hap5(5KB)
----gene_loc_chr1_jh636052_fix(24B)
----gene_loc_chrUn_gl000227(24B)
----gene_loc_chr13(20KB)
----gene_loc_chrUn_gl000215(48B)
----gene_loc_chrUn_gl000219(85B)
----gene_loc_chr19(51KB)
----gene_loc_chrUn_gl000212(20B)
----gene_loc_chr20(22KB)
----gene_loc_chr19_gl949747_alt(22B)
----gene_loc_chr19_gl949746_alt(20B)
----gene_loc_chr7(42KB)
----gene_loc_chrM(29B)
----gene_loc_chr19_gl000209_random(235B)
----gene_loc_chrUn_gl000220(262B)
----gene_loc_chr6_qbl_hap6(6KB)
----gene_loc_chr1_gl000191_random(19B)
----gene_loc_chr21(12KB)
----gene_loc_chr18_gl383571_alt(19B)
----gene_loc_chrUn_gl000223(62B)
----gene_loc_chrX_jh159150_fix(42B)
----gene_loc_chr10(35KB)
----gene_loc_chrUn_gl000211(21B)
----gene_loc_chr6_cox_hap2(6KB)
----gene_loc_chr18(13KB)
----gene_loc_chr4_gl000193_random(22B)
----gene_loc_chr3(49KB)
----gene_loc_chrUn_gl000218(47B)
----gene_loc_chrUn_gl000213(73B)
----gene_loc_chr6_apd_hap1(3KB)
----gene_loc_chr14_kb021645_fix(20B)
----gene_loc_chr19_gl949752_alt(20B)
----gene_loc_chr11_gl949744_fix(16B)
----gene_loc_chr6(45KB)
----gene_loc_chr15(30KB)
----gene_loc_chrUn_gl000241(38B)
----gene_loc_chr6_ssto_hap7(5KB)
----gene_loc_chrX(36KB)
----gene_loc_chr6_mann_hap4(5KB)
----gene_loc_chr4(34KB)
----gene_loc_chrY(4KB)
----gene_loc_chr16(34KB)
----gene_loc_chr7_gl000195_random(22B)