文件名称:bgen:BGEN 文件格式阅读器
文件大小:4.64MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-19 19:26:36
C
基因组 阅读器。 它完全支持 BGEN 格式规范 1.2 和 1.3。 要求 它使用。 你并不需要自己安装它,如果你选择安装BGEN通过,但你确实需要它,如果你自己选择建立BGEN库安装前手。 它还利用在执行耗时的任务时显示进度: 安装 您可以通过conda安装它: conda install -c conda-forge bgen 第二个安装选项是下载最新的源代码并自行构建。 它可以很简单: curl -fsSL https://git.io/JerYI | GITHUB_USER=limix GITHUB_PROJECT=bgen bash 在 Windows 下,请使用 Git Bash 终端输入上述命令。 文档 有关用法和 API 说明,请参阅。 文件说明 原始规范可以在找到。 我们还创建了一个替代的、更。 发展 确保已安装依赖项。 从终端,克隆存储库并签出开发分支:
【文件预览】:
bgen-main
----.clang-format(3KB)
----.gitignore(304B)
----src()
--------report.c(1KB)
--------bstring.h(404B)
--------platform.h(2KB)
--------metafile_write.h(4KB)
--------metafile.c(7KB)
--------bstring.c(1KB)
--------variant.c(4KB)
--------io.h(181B)
--------file.c(7KB)
--------bmath.h(1KB)
--------layout2.h(351B)
--------samples.h(345B)
--------samples.c(1KB)
--------variant.h(581B)
--------layout1.h(351B)
--------zip()
--------partition.h(350B)
--------file.h(443B)
--------mem.h(325B)
--------partition.c(1KB)
--------layout2.c(15KB)
--------free.h(134B)
--------metafile.h(2KB)
--------io.c(2KB)
--------genotype.c(2KB)
--------genotype.h(963B)
--------report.h(586B)
--------layout1.c(4KB)
----LICENSE.md(1KB)
----bgen-config.cmake.in(172B)
----doc()
--------install.rst(861B)
--------.gitignore(23B)
--------requirements.txt(25B)
--------Makefile(633B)
--------index.rst(990B)
--------conf.py(2KB)
--------interface.rst(4KB)
--------Doxyfile(108KB)
--------make.bat(809B)
----.github()
--------workflows()
----README.md(3KB)
----cmake()
--------FindZSTD.cmake(2KB)
----include()
--------bgen()
----test()
--------.gitignore(0B)
--------data()
--------src()
--------CMakeLists.txt(2KB)
----CMakeLists.txt(4KB)
----bgen-file-format.pdf(35KB)