文件名称：bgen-reader-py:BGEN 文件格式阅读器
文件大小：62KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-19 19:18:08
Python
bgen-阅读器 阅读器。 Bgen 是一种用于存储大型遗传数据集的文件格式。 它支持具有可变倍性和等位基因数量的非定相基因型和定相单倍型数据。 它旨在在不牺牲变体访问性能的情况下提供紧凑的数据表示。 这个 python 包是的包装器，这是一个低内存占用的阅读器，可以有效地读取 bgen 文件。 完全支持bgen格式规范：1.2和1.3； 以及它们的可选压缩格式。 安装 它可以通过安装 conda install -c conda-forge bgen-reader 或者通过 pip pip install bgen-reader 文档 请参考 。 故障排除 致命错误：bgen.h：没有那个文件或目录 这意味着未安装 bgen C 库（或找不到）。 请按照的说明进行安装，然后再次尝试安装 bgen-reader。 问题 如果您遇到任何问题，请。 作者 执照 这个项目是在下获得许可的
【文件预览】：
bgen-reader-py-main
----setup.py(92B)
----.clang-format(3KB)
----.gitignore(1KB)
----conftest.py(510B)
----pyproject.toml(166B)
----LICENSE.md(1KB)
----MANIFEST.in(56B)
----.pre-commit-config.yaml(341B)
----setup.cfg(2KB)
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE()
--------workflows()
----README.md(1KB)
----version.py(411B)
----.flake8(61B)
----docs()
--------install.rst(250B)
--------.gitignore(8B)
--------numpyapi.rst(155B)
--------requirements.txt(98B)
--------Makefile(701B)
--------metafile.rst(88B)
--------numpyapi-api.rst(534B)
--------index.rst(2KB)
--------expectation.rst(100B)
--------conf.py(2KB)
--------env_variables.rst(394B)
--------dosage.rst(82B)
--------frequency.rst(92B)
--------make.bat(831B)
--------quickstart.rst(7KB)
--------quickstart2.rst(6KB)
--------daskapi.rst(209B)
--------read.rst(71B)
----bgen_reader()
--------conftest.py(2KB)
--------_reader.py(4KB)
--------_metafile.py(4KB)
--------_multimemmap.py(10KB)
--------_example.py(2KB)
--------__init__.py(1KB)
--------_bgen2.py(54KB)
--------_helper.py(3KB)
--------_samples.py(1013B)
--------_genotype.py(2KB)
--------_testit.py(469B)
--------_environment.py(481B)
--------_dosage.py(12KB)
--------test()
--------_file.py(2KB)