BioAlignments.jl:序列比对工具

时间:2024-05-26 09:10:03
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文件名称:BioAlignments.jl:序列比对工具

文件大小:77KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-26 09:10:03

bam-files bioinformatics biology high-throughput-sequencing dna-sequences

生物比对 描述 BioAlignments.jl提供了序列比对算法和数据结构。 安装 您可以在从Julia REPL安装BioAlignments.jl : pkg> add BioAlignments 如果您对开发的前沿感兴趣,请在发布前检查以尝试新功能。 测验 已在Linux,OS X和Windows上针对Julia 1.X对BioAlignments进行了测试。 最新的构建状态: 贡献 我们感谢用户的贡献,包括报告错误,修复问题,提高性能和添加新功能。 查看贡献文件的详细贡献者和维护者指南以及行为准则。 特别感谢 彼得·哈弗蒂GitHub吞噬 财政捐款 我们也欢迎公开集体完全透明地捐款。 任何人都可以报销。 如果这笔费用对社区的发展有意义,那么核心贡献者将“合并”到我们公开集体的总账中,并且报销费用的人也将获得报销。 支持者和赞助者 感谢我们所有的支持者和赞助者! 喜


【文件预览】:
BioAlignments.jl-master
----Project.toml(675B)
----docs()
--------make.jl(716B)
--------Project.toml(143B)
--------src()
----sticker.svg(1KB)
----.github()
--------FUNDING.yml(25B)
--------PULL_REQUEST_TEMPLATE.md(3KB)
--------ISSUE_TEMPLATE.md(2KB)
--------workflows()
----test()
--------runtests.jl(33KB)
----LICENSE(1KB)
----src()
--------types.jl(1KB)
--------data()
--------submat.jl(8KB)
--------pairwise()
--------operations.jl(4KB)
--------BioAlignments.jl(2KB)
--------models.jl(7KB)
--------alignment.jl(9KB)
--------anchors.jl(650B)
--------alignedseq.jl(4KB)
----.gitignore(806B)
----CHANGELOG.md(3KB)
----README.md(5KB)

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