文件名称：优化与癌症转移相关的与预后相关的关键miRNA-靶标相互作用
文件大小：640KB
文件格式：PDF
更新时间：2024-04-19 10:11:53
miRNA; key miRNA-target interactions; prognosis;
越来越多的证据表明，微小RNA（miRNA）及其下游靶标的异常通常与人类癌症的发病机理有关，但是，很少研究因果miRNA与靶标相互作用的临床益处。 在这里，我们提出了一种计算方法，可以通过结合转录组和临床数据来优化与预后相关的关键miRNA-靶标相互作用，该方法来自16种癌症类型的数千种TCGA肿瘤。 我们获得了112个miRNA与1,443个靶标之间总共1,956个与预后相关的关键miRNA-target相互作用。 有趣的是，这些关键靶基因特别参与了与肿瘤进展相关的功能，例如“细胞粘附”和“细胞迁移”。 此外，通过特征分析，它们与十种不同类型的癌症中的“特征性转移和转移”（具有转移特征）最相关。 这些结果暗示，与预后相关的关键miRNA-靶标相互作用与癌症转移高度相关。 最后，我们观察到这些关键的miRNA-靶标相互作用的组合可以将预后良好的患者与大多数TCGA癌症类型和独立验证集的预后不良的患者区分开，突出了他们在癌症转移中的作用。 我们提供了一个用户友好的数据库，名为miRNATarget（可从http：//biocc.hrbmu..edu.cn/miRNATar/免费获得），该数据库概述了16种癌症类型中与预后相关的关键miRNAtarget相互作用。