Cascade:使用深层网络从钙ΔFF数据中校正峰值的推断

时间:2024-04-24 11:49:06
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文件名称:Cascade:使用深层网络从钙ΔFF数据中校正峰值的推断

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更新时间:2024-04-24 11:49:06

deep-learning calcium-imaging deconvolution spike-detection two-photon

级联:根据钙成像数据进行校准的峰值推断 级联将钙成像ΔF/ F迹线转换为尖峰概率或离散峰值。 在中详细描述了Cascade 。 Cascade的工具箱包括 庞大的地面真相数据库,涵盖大脑区域,钙指示剂,物种 经过训练可根据钙数据预测峰值速率的深度网络 重新训练训练场真相的程序,以便使噪声水平和钙记录的帧率匹配 各种条件下的大量预训练深度网络 量化给定模型和噪声水平的数据集外泛化的工具 将推断的尖峰频率转换为离散尖峰的工具 我们提供了两个Colaboratory Notebook ,无需本地安装即可使用它们来并用于。 只需单击链接! 入门 无需安装 如果您想尝试该算法,只需打开。 使用Notebook,您可以将算法应用于现有的测试数据集,也可以将预训练的模型应用于自己的数据。 由于整个算法都在云中运行,因此无需安装(由Google服务器托管的协作笔记本;需要Google帐户)。 整个N


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