matlab矩阵求和函数代码-nerds:用于从钙成像数据进行尖峰推断的Matlab包

时间:2024-07-02 02:59:21
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文件名称:matlab矩阵求和函数代码-nerds:用于从钙成像数据进行尖峰推断的Matlab包

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更新时间:2024-07-02 02:59:21

系统开源

matlab矩阵求和函数代码书呆子 基于稀疏性的神经事件重建和检测 version 0.1 - 这是 NERDS 的第一个存储库(2014 年 11 月 13 日发布) 相关刊物 戴尔,EL; 斯图德,C.; 罗宾逊,JT; Baraniuk, RG,“从嘈杂和损坏的数据中恢复神经事件的稳健有效的方法”,神经工程 (NER),第 6 届国际 IEEE/EMBS 会议,第 593-596 页,2013 描述 Matlab 包实施盲解卷积方法,用于从钙迹或突触后电位的细胞内记录中恢复神经尖峰。 要求 Matlab 版本 >= 2007 (用于大规模稀疏重建的求解器)另见 git(请注意,我们没有在 NERDS 项目中包含SPGL1 ),因此请确保安装SPGL1并包含在 MATLAB 路径中。 安装 为了下载 NERDS 文件夹,可以直接从 git 存储库下载zip file或使用git使用命令克隆存储库: git clone https://github.com/nerdslab/nerds 您还需要安装SPGL1 ,运行spgsetup.m ,然后添加到 MATLAB 路径。 之后,将鼠


【文件预览】:
nerds-master
----BOB_README.txt(276B)
----compute_nerds.m(4KB)
----setup_nerds.m(134B)
----script_bobdata_to_spikes.m(827B)
----private()
--------NormL1NNpart_dual.m(243B)
--------vec.m(98B)
--------peak_count.m(1KB)
--------spg_bp_NN.m(2KB)
--------gen_new_atom.m(588B)
--------est_gam_dist.m(986B)
--------kernelupdate_gamma.m(698B)
--------NormL1NNpart_project.m(271B)
--------README.md(190B)
--------NormL1NNpart_primal.m(143B)
--------dumb_dict.m(236B)
--------dict.m(360B)
--------LSdict.m(206B)
--------constrained_LS.m(1KB)
--------rescale.m(207B)
--------peak_sum.m(1011B)
--------zero_pad.m(310B)
----example_nerds.m(2KB)
----corrected_traces_exptcont_511509529_sessionA.mat(94.94MB)
----corrected_traces_exptcont_511509529_sessionB.mat(92.71MB)
----README.md(5KB)
----example_synth.m(2KB)
----example_synth_data.mat(31KB)
----example_real_data.mat(362KB)
----nerds_figures()
--------nerd_example.png(96KB)
--------nerd_synth_result2.png(78KB)
--------nerds_realdata.png(247KB)
--------README.md(107B)
--------nerd_synth_result1.png(112KB)
----download_bob_data.ipynb(44KB)

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