文件名称:matlab有些代码不运行-oopsi:最新的代码,用于基于模型的钙成像推断峰序列
文件大小:29KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 15:53:08
系统开源
matlab有些代码不运行现已提供用于快速oops的更好的算法/实现 钙成像和分析的标准工具箱是,它以多种不错的方式扩展了我们的工作(它们具有Python和MATLAB) 一个非常好的R包:,基于以下两篇文章 恕我直言,除非您真的想使用基于粒子过滤器的方法,否则没有理由再使用此存储库了,我建议您将上述代码用于R,python和matlab。 oopsi算法信息 这是一个回购,其中包含用于执行钙成像基于模型的峰值序列推断的最新代码。 可以从fast-oopsi,smc-oopsi和pop-oopsi github存储库中获得解释理论的手稿,并提供有关模拟数据和真实数据的一些结果。 这些存储库还包含您可以运行的代码以及可下载以与事物玩耍的数据。 如有任何问题,请在“问题”标签中询问他们。 请让我知道任何积极或消极的经历。 非常有义务,jovo 我们经常遇到的一个问题是:“我们将如何解释输出?尖峰的概率?瞬时点火率?” 答案是:是的,也许是:) “问题”是缺少校准数据,这意味着我们不知道单个尖峰诱发的钙瞬变的绝对大小。 我们可以根据数据进行估算,但例如,如果神经元碰巧总是两次尖峰,我们的估算
【文件预览】:
oopsi-master
----run_oopsi.m(9KB)
----z1.m(311B)
----CONTRIBUTING(249B)
----fast_oopsi.m(18KB)
----Hill_v1.m(100B)
----smc_oopsi_forward.m(22KB)
----smc_oopsi_m_step.m(10KB)
----README.md(2KB)
----smc_oopsi.m(5KB)
----license.md(11KB)
----smc_oopsi_backward.m(6KB)
----demo.m(1KB)